Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mvb12bQ6KAU4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms