Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6GQU0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms