Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg9bQ6EBV9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg9bQ6EBV9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms