Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6DFW0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6DFW0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6DFW0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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