Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2bQ64511 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2bQ64511 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2bQ64511 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2bQ64511 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Top2bQ64511 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms