Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms