Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtmQ62388 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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AtmQ62388 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AtmQ62388 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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