Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sprr1bQ62267 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms