Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sall3Q62255 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms