Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kdm5dQ62240 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5dQ62240 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms