Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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VcanQ62059 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VcanQ62059 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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VcanQ62059 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VcanQ62059 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VcanQ62059 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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VcanQ62059 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VcanQ62059 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VcanQ62059 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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