Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Odf1Q61999 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms