Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Npm1Q61937 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms