Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hes3Q61657 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Hes3Q61657 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms