Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hcfc1Q61191 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hcfc1Q61191 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hcfc1Q61191 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hcfc1Q61191 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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