Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prpf4bQ61136 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prpf4bQ61136 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms