Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SkiQ60698 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SkiQ60698 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms