Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PtprnQ60673 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PtprnQ60673 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PtprnQ60673 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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