Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms