Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms