Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim41Q5NCC3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms