Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Spire1Q52KF3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms