Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trp53i11Q4QQM4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trp53i11Q4QQM4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trp53i11Q4QQM4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trp53i11Q4QQM4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trp53i11Q4QQM4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trp53i11Q4QQM4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trp53i11Q4QQM4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trp53i11Q4QQM4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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