Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm6899Q3USS0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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