Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Znf48Q3US17 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Znf48Q3US17 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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