Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zfp953Q3UPV7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms