Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms