Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smu1Q3UKJ7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms