Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pcgf5Q3UK78 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcgf5Q3UK78 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms