Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmod2Q3UHZ5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms