Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Garem1Q3UFT3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms