Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Puf60Q3UEB3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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