Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atxn7l3bQ3UD01 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atxn7l3bQ3UD01 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atxn7l3bQ3UD01 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn7l3bQ3UD01 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms