Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LcorlQ3U285 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms