Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkl4Q3TZA2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms