Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd2Q149F1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd2Q149F1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 756.1 ms