Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc162pQ0VG85 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc162pQ0VG85 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms