Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem52bQ0VBF2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tmem52bQ0VBF2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms