Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubxn2bQ0KL01 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms