Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnma1Q08460 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms