Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Calb2Q08331 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb2Q08331 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms