Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgm3Q08189 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgm3Q08189 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms