Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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F13bQ07968 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
F13bQ07968 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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