Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms