Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gdf3Q07104 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gdf3Q07104 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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