Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Siah1bQ06985 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms