Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh3bp2Q06649 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sh3bp2Q06649 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms