Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fmn1Q05860 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fmn1Q05860 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms