Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Sox12Q04890 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sox12Q04890 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms