Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CkbQ04447 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms